中國水產科學研究院珠江所在月鱧基因組研究取得進展
時間:2025-07-16 09:55 來源:中國水產科學研究院 原文:
近日,中國水產科學研究院珠江水產研究所育種室趙建研究團隊在月鱧(Channa asiatica)基因組資源解析取得了重要進展。相關研究論文“A chromosome-level reference genome assembly of the Small snakehead (Channa asiatica)”已發表于SCI期刊《Scientific Data》(JCR1區,IF2025=6.9)。該研究得到了國家現代農業產業技術體系(CARS-46)等項目的資助,珠江所為第一完成單位,劉海洋和劉嘉峰為第一作者,趙建研究員和歐密副研究員為共同通訊作者。


月鱧是一種具有重要經濟價值的水產養殖和觀賞魚類,廣泛分布于中國南方及東南亞地區。由于其獨特的體表花紋和強大的生命力,月鱧在水產養殖和水族愛好者中深受青睞。然而,由于此前該物種的基因組資源較為匱乏,相關的遺傳學研究和育種項目尚未得到充分開展。
本研究團隊采用PacBio HiFi長讀長測序、Illumina短讀長測序及Hi-C技術,成功構建了月鱧雄性基因組的高質量染色體水平組裝。最終組裝的基因組長度為659.44Mb,其中98.18%的序列成功錨定至23條染色體,展現了出色的基因組組裝質量。該基因組的contig N50和scaffold N50分別為23.92Mb和29.61Mb,顯示出高水平的組裝結果。
在基因注釋方面,研究團隊共鑒定出26,603個編碼蛋白質的基因,且BUSCO評估完整度達到99.29%,功能注釋率為93.68%。通過與烏鱧(C. argus)、斑鱧(C. maculata)等近緣物種的基因組共線性比較,研究揭示了鱧科魚類染色體的進化規律。本研究為月鱧功能基因研究、比較基因組學及進化研究奠定了堅實的基礎。通過對基因組數據的深入分析,研究團隊期望在未來能識別與關鍵經濟性狀相關的功能基因,推動月鱧的精準育種和遺傳改良。
全文鏈接:https://doi.org/10.1038/s41597-025-05479-7